Spôsobuje nový variant len mierne stavy a fungujú vakcíny? Svet sleduje vývoj v Južnej Afrike

Ešte pred desiatimi dňami prežívala Juhoafrická republika najlepšie obdobie počas pandémie. Krajina, ktorá predtým zažila tri ťažké vlny covidu, hlásila do tristo nových prípadov denne, čo je asi toľko, ako keby u nás bolo 28 pozitívnych. Aj miera pozitivity (1 percento) tu bola najlepšia od začiatku pandémie.

V priebehu týždňa však išli počty prípadov – najmä v najľudnatejšej provincii Gauteng – rýchlo hore. V nedeľu krajina hlásila 2800 prípadov. To je stále vzhľadom na 59-miliónovú krajinu (a v porovnaní s vlnou v Európe) málo, no taký silný nástup novej vlny sa často nevidí.

Koncom týždňa už očakávajú 10-tisíc prípadov denne.

Môže to naznačovať, že nový variant omikron, ktorý tu vedci objavili len minulý utorok a už vo štvrtok alarmovali svet, sa šíri rýchlejšie ako predchádzajúce varianty. Veľmi rýchlo takisto nahradil predchádzajúci delta variant v krajine. Vedci síce sekvenovali v JAR len 109 prípadov, no vďaka PCR metóde sa dá predpokladať, že omikron už tvorí 90 percent prípadov v provincii Guateng.

Medzi mladými

V pondelok doobeda usporiadalo juhoafrické ministerstvo zdravotníctva prezentáciu s vedcami, kde informovalo o vývoji pandémie aj o tom, čo nové sa vie o omikrone. Vzhľadom na to, že krajina je zatiaľ jediná, kde sa dá hovoriť o veľkom šírení omikronu, práve informácie z tohto štátu môžu byť dôležité pre celý svet.

V krajine od marca 2020 nebol taký rýchly rast prípadov. Za týždeň narástli o 300 percent. Je to však vzostup z malého počtu prípadov. Napríklad aj Holandsko zažilo v júli raketový nárast prípadov (500 percent za týždeň), no veľa ľudí sa vtedy infikovalo na festivaloch a diskotékach, teda bolo veľa superšíriteľských udalostí. Keď tieto akcie zakázali, počty prípadov padli dole.

V Južnej Afrike sa vírus teraz takisto šíri hlavne medzi mladými ľuďmi, na školách či univerzitách. Najviac zasiahnutá je práve provincia Gauteng, kde žije štvrtina populácie a ležia tu mestá ako Johannesburg či hlavné mesto Pretória. Aj v minulých vlnách sa vírus šíril najskôr tam a potom sa pridal aj zvyšok krajiny. V častiach provincie bola už miera pozitivity 30 percent.

"Aj keď je možné, že mutácia vírusu znamená, že má vyššiu mieru infekcie, stále to nebolo dokázané," povedal popredný nemecký virológ Christian Dorsten pre Spiegel.

Miera pozitivity v regiónoch JAR

Here's the original high-res image prepared last Monday, covering the week 14-20Nov. Gauteng is the entire area in the first map.

The national picture , as of 20 November - the maps for the week to 27/11 get produced tomorrow - is far less dramatic pic.twitter.com/zI0QvpvEkd

— Tom Moultrie (@tom-moultrie.bsky.social) (@tomtom_m) November 28, 2021

Priebeh nákazy

Otázka je, ako vážne stavy vyvoláva nový variant u infikovaných. Tu sa zatiaľ zdá, že by nemusel byť horší ako delta, všetko sú to však prvotné pozorovania.

"Je nebezpečný? Krátka odpoveď je, že zatiaľ skutočne nevieme a bude to trvať najmenej dva či tri týždne, aby sme pochopili vážnosť choroby, ktorú spôsobuje," napísali juhoafrickí odborníci na čele s virológom Jeffrey Dorfmanom pre Daily Maverick.

“Nemáme jednoducho tvrdé, spoľahlivé informácie, zatiaľ sme však nevideli žiadne varovné signály," povedal profesor Salim Abdool Karim podľa médií.

Predsedníčka Juhoafrickej lekárskej asociácie Angélique Coetzee pre BBC cez víkend povedala, že prípady, ktoré boli doteraz identifikované v Juhoafrickej republike, nie sú vážne. „Symptómy boli odlišné a miernejšie ako tie, ktoré som predtým liečila,“ uviedla. Pacienti sa podľa nej sťažujú na bolesti tela a únavu.

Iný všeobecný lekár počas prezentácie povedal, že príznaky sa podobajú na chrípku. Jeho pacienti majú suchý kašeľ, horúčku či bolesti tela. Väčšinou sú však symptómy mierne.

Treba však dodať, že väčšinou sú zatiaľ infikovaní mladší pacienti, ktorí majú aj u predchádzajúcich variantov miernejšie príznaky.

Počty hospitalizovaných v nemocniciach v tejto provincii Guateng rastú, ako ukázali informácie na prezentácii. Ich nárast je tu však menší ako nárast počtu prípadov.

Medzitýždenný nárast prípadov (modrá) a hospitalizácii v provincii Gauteng. Zdroj - prezentácia ministerstva zdravotníctva  

Stále takisto nevieme priradiť konkrétne prípady hospitalizácie ku konkrétnemu variantu. Juhoafrická republika má však veľmi dobre spracované pandemické dáta a odborníci teraz robia na tom, aby spojili PCR testy, ktoré naznačujú variant omikron, s hospitalizáciami, čo by naznačovalo vážnosť ochorenia.

Čo očkovanie?

V prípade ochrany očkovaním juhoafrickí odborníci stále nehovoria nič nové. Omikron má až vyše 30 mutácií na S proteíne, ktorým vírus vniká do bunky a na ktorý sú zamerané vakcíny. To je dvakrát toľko ako delta, navyše má niektoré mutácie, ktoré sa už pri iných variantoch spájali so zníženou ochranou.

Ako je to reálne s ochranou v Južnej Afrike, nevieme. V nemocniciach tvoria 17 percent plne zaočkovaní, v krajine ich je 24 percent z celej populácie.

Vedci teraz skúmajú vplyv variantu na vakcíny v laboratórnych podmienkach. Robia to aj spoločnosti, ako sú Pfizer a Moderna. Prvé výsledky by mali byť o dva týždne.

Podľa odborníkov by mohla byť účinnosť vzhľadom na množstvo mutácií nižšia. Na druhej strane variant by nemal až natoľko unikať T-bunkám.

"Všetko čo vieme, naznačuje, že všetky v súčasnosti prístupné vakcíny v Južnej Afrike poskytujú aspoň nejakú ochranu proti vážnemu ochoreniu, hospitalizácii a úmrtiam dokonca aj na tento nový variant," napísali odborníci na čele s virológom Dorfmanom.

"Myslím si, že najpravdepodobnejší výsledok bude oslabená imunita, no nie úplná strata imunity," povedal pre Guardian profesor Paul Morgan z Cardiffskej univerzity.

Ak by sa však zistilo, že vakcíny nechránia pred hospitalizáciou a smrťou až natoľko ako doteraz, spoločnosti ako Pfizer a Moderna hovoria o možnosti "aktualizovať" vakcíny na nový kmeň. Trvalo by to niekoľko mesiacov.

Počty prípadov stúpajú najmä v provincii Gauteng

Zatvorené hranice

Podľa amerického virológa Trevora Bedforda mohol variant omikron vzniknúť niekedy v septembri alebo októbri. Vychádza z analýzy jeho "genetických spoločných predkov".

Prvý prípad zistili v Južnej Afrike 9. novembra. To nutne neznamená, že v tejto krajine variant aj vznikol (je možné, že v pacientovi s ochorením AIDS, ktorý dlho bojoval s chorobou). Táto africká krajina má však svetové schopnosti analýzy genómu a vírus možno len prvá objavila.

To je jeden z dôvodov, prečo sa miestni politici aj vedci hnevajú na zatvorené hranice. Hovoria, že krajiny aj tak nezabránia šíreniu vírusu a poškodí to ich ekonomiku (veľká časť HDP v krajine tvorí turizmus - Európania cestujúci na safari).

Navyše to môže do budúcna spôsobiť, že krajiny budú menej ochotné zdieľať informácie o nových variantoch. Krajina, ktorá v podstate v priebehu hodín upozornila svet na omikron, za odmenu skončila "v cestovateľskej blokáde".

Ľudí z Južnej Afriky a ďalších okolitých krajín nepúšťa USA, Británia ani štáty Európskej únie. Niektoré štáty zašli ešte ďalej, keď sa úplne zavreli pred cudzincami (Japonsko, Izrael). Maroko dokonca na dva týždne zrušilo všetky prichádzajúce a odchádzajúce lety a nepustí dnu ani svojich vlastných občanov.

V Európe ďalšie prípady

Z Európy zatiaľ prichádzajú ďalšie správy o identifikovaných prípadoch variantu omikron. Naznačujú, že môže byť viac rozšírený, ako sa zdalo.

V Škótsku objavili variant u šiestich ľudí, niektorí nikam necestovali, a už sa hovorí o komunitnom šírení. V Taliansku variant potvrdili u muža, ktorý pricestoval z Mozambiku pred dvoma týždňami.

V Portugalsku pravdepodobne našli 13 prípadov variantu omikron v spojitosti s lisabonským futbalovým klubom Beleneses. Nový kmeň zrejme priniesol jeden z hráčov, ktorý hral v Južnej Afrike zápas.

Tento klub vzbudil pozornosť už koncom minulého týždňa, keď odohral zápas s Benficou Lisabon aj napriek tomu, že mal k dispozícii iba 9 zdravých hráčov (väčšinou mladíkov, z toho dvoch brankárov). Po tom, čo počas duelu odstúpili ďalší traja hráči, sa napokon zápas nedohral.